9月1日，开展全民健康生活方式日宣传活动。

9月6日，老龄人群健康与环境可控因素研究项目城北乡现场调查工作顺利结束。

9月8日，完成省食品药品检验研究院食品中沙门氏菌检测能力考核。

9月9日，开展月度风险评估。

9月9日，开展2016年六安城区（市人民医院、市卫生监督局，市中医院，六安阳光眼科医院）职业病报告与重点职业病监测工作中期督导检查工作。

9月12日-14日，我市代表队参加安徽省寄生虫防治技术竞赛，获团体三等奖。市疾控中心高大维和舒城县疾控中心罗大林分别获个人三等奖。

9月19日，完成第三季度城市生活饮用水水样采集工作，共采集27份水样。

9月20日，到市拘留所开展羁押人员HIV筛查工作，共采血35份。

9月21-23日，我市代表队参加2016年省预防接种技能大赛，获优秀组织奖，金安区杨勋柱获个人综合三等奖。

9月23日，召开全市艾滋病抗病毒治疗研讨会，讨论全市艾滋病治疗失败、免疫重建不良、药物不良反应等病例的解决方案。

9月26日，国家疾控中心督导我市淮河流域癌症综合防治项目工作。

9月26日，举办2016年六安市结核病实验室检验技能竞赛。裕安区代表队获得的团体第一名，霍山县代表队获得了团体第二名，舒城县代表队获得了团体第三名。

9月30日，启动A群C群脑膜炎球菌结合疫苗免疫效果及持久性观察研究。

9月，质管科窗口受理各类检测样品410份，其中工作场所87份、公共场所233份、食品风险监测理化样40份、自来水样30份，血液酒精含量检测20份。

9月，微生物检验科完成671份1622项次指标检测，理化检验科完成220份310项次指标检测。

9月，预防接种门诊体检326人次，预防接种1267人次，处置动物咬抓伤381人。